Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms