Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms