Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Cngb1E1AZ71 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cngb1E1AZ71 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cngb1E1AZ71 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cngb1E1AZ71 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Cngb1E1AZ71 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cngb1E1AZ71 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cngb1E1AZ71 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cngb1E1AZ71 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cngb1E1AZ71 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cngb1E1AZ71 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cngb1E1AZ71 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cngb1E1AZ71 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cngb1E1AZ71 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cngb1E1AZ71 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Cngb1E1AZ71 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Cngb1E1AZ71 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Cngb1E1AZ71 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cngb1E1AZ71 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Cngb1E1AZ71 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cngb1E1AZ71 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cngb1E1AZ71 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cngb1E1AZ71 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Cngb1E1AZ71 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cngb1E1AZ71 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cngb1E1AZ71 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cngb1E1AZ71 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Cngb1E1AZ71 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cngb1E1AZ71 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cngb1E1AZ71 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cngb1E1AZ71 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cngb1E1AZ71 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Cngb1E1AZ71 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Cngb1E1AZ71 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Cngb1E1AZ71 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cngb1E1AZ71 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cngb1E1AZ71 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms