Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms