Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms