Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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