Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms