Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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