Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmf1B9EKI3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmf1B9EKI3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmf1B9EKI3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmf1B9EKI3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmf1B9EKI3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmf1B9EKI3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmf1B9EKI3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmf1B9EKI3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmf1B9EKI3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmf1B9EKI3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmf1B9EKI3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmf1B9EKI3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmf1B9EKI3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmf1B9EKI3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmf1B9EKI3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmf1B9EKI3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmf1B9EKI3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmf1B9EKI3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmf1B9EKI3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmf1B9EKI3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmf1B9EKI3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmf1B9EKI3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmf1B9EKI3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmf1B9EKI3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmf1B9EKI3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmf1B9EKI3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmf1B9EKI3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmf1B9EKI3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmf1B9EKI3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmf1B9EKI3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmf1B9EKI3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmf1B9EKI3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmf1B9EKI3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmf1B9EKI3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmf1B9EKI3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmf1B9EKI3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmf1B9EKI3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmf1B9EKI3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmf1B9EKI3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmf1B9EKI3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmf1B9EKI3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmf1B9EKI3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmf1B9EKI3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmf1B9EKI3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmf1B9EKI3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmf1B9EKI3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmf1B9EKI3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmf1B9EKI3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmf1B9EKI3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmf1B9EKI3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmf1B9EKI3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmf1B9EKI3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmf1B9EKI3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmf1B9EKI3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmf1B9EKI3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmf1B9EKI3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
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