Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms