Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ57

Mterf1b, Transcription termination factor 1b, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1bB9EJ57 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms