Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms