Protein–RNA interactions for Protein: B2RVB7

Hbb-bh2, Globin b2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh2B2RVB7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms