Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Abcc8B2RUS7 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Abcc8B2RUS7 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Abcc8B2RUS7 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Abcc8B2RUS7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Abcc8B2RUS7 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Abcc8B2RUS7 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Abcc8B2RUS7 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Abcc8B2RUS7 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Abcc8B2RUS7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Abcc8B2RUS7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Abcc8B2RUS7 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Abcc8B2RUS7 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Abcc8B2RUS7 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Abcc8B2RUS7 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Abcc8B2RUS7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Abcc8B2RUS7 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Abcc8B2RUS7 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Abcc8B2RUS7 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Abcc8B2RUS7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Abcc8B2RUS7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Abcc8B2RUS7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Abcc8B2RUS7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Abcc8B2RUS7 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Abcc8B2RUS7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Abcc8B2RUS7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Abcc8B2RUS7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Abcc8B2RUS7 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Abcc8B2RUS7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Abcc8B2RUS7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Abcc8B2RUS7 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Abcc8B2RUS7 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms