Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms