Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
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