Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms