Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms