Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms