Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trabd2bB1ATG9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trabd2bB1ATG9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trabd2bB1ATG9 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trabd2bB1ATG9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trabd2bB1ATG9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trabd2bB1ATG9 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trabd2bB1ATG9 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Trabd2bB1ATG9 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Trabd2bB1ATG9 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trabd2bB1ATG9 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trabd2bB1ATG9 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trabd2bB1ATG9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trabd2bB1ATG9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trabd2bB1ATG9 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trabd2bB1ATG9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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Trabd2bB1ATG9 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Trabd2bB1ATG9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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Trabd2bB1ATG9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Trabd2bB1ATG9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Trabd2bB1ATG9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Trabd2bB1ATG9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Trabd2bB1ATG9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Trabd2bB1ATG9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Trabd2bB1ATG9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Trabd2bB1ATG9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trabd2bB1ATG9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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