Protein–RNA interactions for Protein: B1ARV6

Pramef20, PRAME family member 20, mousemouse

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Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef20B1ARV6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Pramef20B1ARV6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Pramef20B1ARV6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Pramef20B1ARV6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms