Protein–RNA interactions for Protein: B1AQL3

Tmem235, Transmembrane protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem235B1AQL3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmem235B1AQL3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmem235B1AQL3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmem235B1AQL3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmem235B1AQL3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmem235B1AQL3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Tmem235B1AQL3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tmem235B1AQL3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem235B1AQL3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem235B1AQL3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem235B1AQL3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem235B1AQL3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tmem235B1AQL3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem235B1AQL3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem235B1AQL3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem235B1AQL3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem235B1AQL3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem235B1AQL3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem235B1AQL3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem235B1AQL3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tmem235B1AQL3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tmem235B1AQL3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem235B1AQL3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem235B1AQL3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem235B1AQL3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem235B1AQL3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem235B1AQL3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem235B1AQL3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem235B1AQL3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem235B1AQL3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Tmem235B1AQL3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Tmem235B1AQL3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Tmem235B1AQL3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem235B1AQL3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Tmem235B1AQL3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Tmem235B1AQL3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Tmem235B1AQL3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Tmem235B1AQL3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Tmem235B1AQL3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem235B1AQL3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem235B1AQL3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Tmem235B1AQL3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem235B1AQL3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem235B1AQL3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem235B1AQL3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Tmem235B1AQL3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem235B1AQL3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem235B1AQL3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Tmem235B1AQL3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem235B1AQL3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem235B1AQL3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem235B1AQL3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem235B1AQL3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem235B1AQL3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms