Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms