Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms