Protein–RNA interactions for Protein: A3KG49

Gm5640, Predicted gene 5640, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5640A3KG49 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm5640A3KG49 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms