Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Atp8b5A3FIN4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Atp8b5A3FIN4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Atp8b5A3FIN4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Atp8b5A3FIN4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Atp8b5A3FIN4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Atp8b5A3FIN4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Atp8b5A3FIN4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp8b5A3FIN4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp8b5A3FIN4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms