Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.6 ms