Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms