Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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