Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttll9A2APC3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttll9A2APC3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttll9A2APC3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttll9A2APC3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttll9A2APC3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttll9A2APC3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttll9A2APC3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttll9A2APC3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttll9A2APC3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms