Protein–RNA interactions for Protein: A2AIR5

Grin3a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA3A, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3aA2AIR5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin3aA2AIR5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin3aA2AIR5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin3aA2AIR5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms