Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms