Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Frmpd4A2AFR3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms