Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms