Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms