Protein–RNA interactions for Protein: A2A6C4

Sppl2c, Signal peptide peptidase-like 2C, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl2cA2A6C4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sppl2cA2A6C4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Sppl2cA2A6C4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sppl2cA2A6C4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sppl2cA2A6C4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sppl2cA2A6C4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sppl2cA2A6C4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sppl2cA2A6C4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sppl2cA2A6C4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sppl2cA2A6C4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sppl2cA2A6C4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sppl2cA2A6C4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sppl2cA2A6C4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sppl2cA2A6C4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sppl2cA2A6C4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sppl2cA2A6C4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sppl2cA2A6C4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sppl2cA2A6C4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sppl2cA2A6C4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sppl2cA2A6C4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sppl2cA2A6C4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sppl2cA2A6C4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sppl2cA2A6C4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sppl2cA2A6C4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sppl2cA2A6C4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sppl2cA2A6C4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms