Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cul4bA2A432 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms