Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms