Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5J5

Trbv31, T cell receptor beta, variable 31, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trbv31A0A075B5J5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Trbv31A0A075B5J5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Trbv31A0A075B5J5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Trbv31A0A075B5J5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Trbv31A0A075B5J5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trbv31A0A075B5J5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trbv31A0A075B5J5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trbv31A0A075B5J5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trbv31A0A075B5J5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trbv31A0A075B5J5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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