Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUF6

LINC00336, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00336, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00336Q6ZUF6 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC1.07□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC1.06□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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LINC00336Q6ZUF6 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
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LINC00336Q6ZUF6 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
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LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LINC00336Q6ZUF6 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
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