Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC0.96□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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