Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CLPPQ16740 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
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