Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CDKN3Q16667 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
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