Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
APOFQ13790 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
APOFQ13790 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
APOFQ13790 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
APOFQ13790 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
APOFQ13790 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
APOFQ13790 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.66□□□□□ -2.3
APOFQ13790 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
APOFQ13790 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
APOFQ13790 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
APOFQ13790 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
APOFQ13790 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
APOFQ13790 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
APOFQ13790 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
APOFQ13790 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
APOFQ13790 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
APOFQ13790 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
APOFQ13790 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
APOFQ13790 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
APOFQ13790 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
APOFQ13790 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
APOFQ13790 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
APOFQ13790 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
APOFQ13790 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
APOFQ13790 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
APOFQ13790 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
APOFQ13790 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
APOFQ13790 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
APOFQ13790 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
APOFQ13790 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
APOFQ13790 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
APOFQ13790 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
APOFQ13790 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
APOFQ13790 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
APOFQ13790 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
APOFQ13790 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
APOFQ13790 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
APOFQ13790 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
APOFQ13790 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
APOFQ13790 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
APOFQ13790 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
APOFQ13790 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
APOFQ13790 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
APOFQ13790 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
APOFQ13790 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
APOFQ13790 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
APOFQ13790 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
APOFQ13790 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
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APOFQ13790 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
APOFQ13790 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
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APOFQ13790 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
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APOFQ13790 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
APOFQ13790 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
APOFQ13790 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
APOFQ13790 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
APOFQ13790 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.62□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
APOFQ13790 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
APOFQ13790 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
APOFQ13790 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
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