Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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