Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TTPAP49638 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TTPAP49638 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TTPAP49638 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TTPAP49638 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TTPAP49638 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
TTPAP49638 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TTPAP49638 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TTPAP49638 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
TTPAP49638 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TTPAP49638 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TTPAP49638 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TTPAP49638 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
TTPAP49638 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
TTPAP49638 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TTPAP49638 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TTPAP49638 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TTPAP49638 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TTPAP49638 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TTPAP49638 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TTPAP49638 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TTPAP49638 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TTPAP49638 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TTPAP49638 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
TTPAP49638 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
TTPAP49638 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
TTPAP49638 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TTPAP49638 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TTPAP49638 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TTPAP49638 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TTPAP49638 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TTPAP49638 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TTPAP49638 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TTPAP49638 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TTPAP49638 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TTPAP49638 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TTPAP49638 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TTPAP49638 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
TTPAP49638 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
TTPAP49638 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
TTPAP49638 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TTPAP49638 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TTPAP49638 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TTPAP49638 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
TTPAP49638 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TTPAP49638 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TTPAP49638 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TTPAP49638 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TTPAP49638 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TTPAP49638 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
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TTPAP49638 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
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TTPAP49638 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TTPAP49638 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TTPAP49638 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TTPAP49638 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TTPAP49638 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
TTPAP49638 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC0.62□□□□□ -2.31
TTPAP49638 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
TTPAP49638 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
TTPAP49638 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TTPAP49638 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TTPAP49638 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TTPAP49638 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TTPAP49638 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TTPAP49638 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
TTPAP49638 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TTPAP49638 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TTPAP49638 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TTPAP49638 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TTPAP49638 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TTPAP49638 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TTPAP49638 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
TTPAP49638 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
TTPAP49638 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TTPAP49638 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC0.61□□□□□ -2.31
TTPAP49638 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TTPAP49638 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TTPAP49638 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
TTPAP49638 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC0.61□□□□□ -2.31
TTPAP49638 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TTPAP49638 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TTPAP49638 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TTPAP49638 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TTPAP49638 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TTPAP49638 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
TTPAP49638 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
TTPAP49638 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
TTPAP49638 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TTPAP49638 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC0.6□□□□□ -2.31
TTPAP49638 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TTPAP49638 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.6□□□□□ -2.31
TTPAP49638 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TTPAP49638 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
TTPAP49638 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TTPAP49638 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TTPAP49638 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
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