Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GDE1Q9NZC3 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GDE1Q9NZC3 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GDE1Q9NZC3 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GDE1Q9NZC3 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GDE1Q9NZC3 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GDE1Q9NZC3 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GDE1Q9NZC3 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GDE1Q9NZC3 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GDE1Q9NZC3 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GDE1Q9NZC3 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GDE1Q9NZC3 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GDE1Q9NZC3 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GDE1Q9NZC3 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GDE1Q9NZC3 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GDE1Q9NZC3 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GDE1Q9NZC3 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GDE1Q9NZC3 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GDE1Q9NZC3 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GDE1Q9NZC3 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GDE1Q9NZC3 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
GDE1Q9NZC3 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
GDE1Q9NZC3 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GDE1Q9NZC3 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GDE1Q9NZC3 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GDE1Q9NZC3 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GDE1Q9NZC3 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GDE1Q9NZC3 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GDE1Q9NZC3 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GDE1Q9NZC3 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
GDE1Q9NZC3 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
GDE1Q9NZC3 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GDE1Q9NZC3 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GDE1Q9NZC3 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GDE1Q9NZC3 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GDE1Q9NZC3 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
GDE1Q9NZC3 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GDE1Q9NZC3 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GDE1Q9NZC3 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
GDE1Q9NZC3 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GDE1Q9NZC3 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GDE1Q9NZC3 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GDE1Q9NZC3 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GDE1Q9NZC3 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GDE1Q9NZC3 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GDE1Q9NZC3 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GDE1Q9NZC3 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GDE1Q9NZC3 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
GDE1Q9NZC3 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
GDE1Q9NZC3 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.3 ms