Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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CCDC96Q2M329 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
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CCDC96Q2M329 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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CCDC96Q2M329 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC96Q2M329 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC96Q2M329 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC96Q2M329 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC96Q2M329 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC96Q2M329 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC96Q2M329 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC96Q2M329 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC96Q2M329 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC96Q2M329 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC96Q2M329 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC96Q2M329 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC96Q2M329 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC96Q2M329 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC96Q2M329 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC96Q2M329 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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