Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.62□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC1.61□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.4 ms