Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.66□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HOXD10P28358 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
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